قلعه مظفری یکی دیگر از جاذبه های تاریخی شهرستان سلسله قلعه مظفری است که در مرکز شهر الشتر و در خیابان امام خمینی واقع شده است.این قلعه با چهار برج ساخته شده است که در حال حاضر یک برج دایره شکل از آن باقی مانده است.